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點擊化學(ClickChemistry)標記細菌和DNA

更新時間:2021-09-15   點擊次數:2307次

標記大腸桿菌

微生物細胞表面表達的蛋白質可用于各種應用并對其進行操作。它們已被證明在廣泛的領域非常有用,包括蛋白質工程、抗體片段篩選、全細胞催化劑、生物修復吸附劑等 。然而,一個主要的限制是只有 20 種天然存在的氨基酸。如果可以擴展表達的氨基酸組或用合成衍生物專門替換某些氨基酸,則可以進一步操縱表面蛋白,潛在應用的數量將呈指數增加。在這個方向上,一些研究小組已經取得了顯著的成功。


利用 HDC 反應的高可靠性,Link 和 Tirrell 將一種含疊氮化物的合成氨基酸摻入大腸桿菌的表面蛋白質中 。他們選擇的氨基酸是疊氮高丙氨酸 (AHA)。之前已經表明 AHA 可以替代蛋白質中的甲硫氨酸殘基  并且大腸桿菌的外膜蛋白 C (OmpC) 包含三個這樣的殘基。還創建了每個 OmpC 含有九個甲硫氨酸殘基的突變大腸桿菌用于比較。一旦 AHA 被納入 OmpC 中,使用生物素化炔試劑進行點擊反應。兩種細胞都被成功地生物素化,但只有突變的大腸桿菌會與大分子抗生物素蛋白結合,這可能是由于額外的甲硫氨酸殘基周圍的空間擁擠較少。


標記 DNA

寡核苷酸代表了一類非常重要的生物分子。盡管過去由于缺乏知識,它們一直被制藥界“回避",但它們最近發現了許多應用,并被認為是許多研究領域最重要的工具。它們已被用于基因治療、作為治療白血病等疾病的反義劑、作為分子探針  等。添加不同的官能團進一步增加了它們的多功能性,特別是當人們認為可以引入功能化時在 3' 端、5' 端或內部位置。新添加的官能團可以作為與各種生物分子進行生物偶聯的手柄。然而,目前用于 DNA 生物偶聯的方法效率低下。該程序必須能夠耐受水性條件,產生高產率,并且由此產生的連接必須在生物條件下穩定。這是點擊化學的理想情況。


利用 HDC 反應,Seo 等人。能夠將熒光團標記到單鏈 DNA 的 5' 末端 。寡核苷酸經過多次反應修飾,在其 5' 端顯示末端炔烴,熒光團包含疊氮基官能團。獲得了 91% 的產物收率,但在反應中沒有使用催化劑,導致 1,4-取代和 1,5-取代的 1,2,3-三唑產物的混合物。如果使用銅催化劑,則很可能僅產生 1,4-取代的三唑,并且反應進行得更快。西拉等人。將 DNA 標記更進一步,合成了核苷,每個核苷的芳香核堿基上都含有一個末端炔烴。修飾的脫氧腺苷 (dA)、脫氧鳥苷 (dG)、脫氧胞苷 (dC) 和脫氧胸苷 (dT) 均包括在內。使用固相合成,隨后合成了幾種寡核苷酸,其中含有一種修飾的核苷、兩種或根本不含(作為對照)。寡核苷酸及其雙鏈體的特性不受修飾的核苷的顯著影響,與對照相比時相似的解鏈溫度證明了這一點。然后通過點擊化學將含有疊氮基官能團的報告分子與修飾的堿基綴合。結合后,報告分子開始發出熒光,表明寡核苷酸已被成功標記。如果商業化,Seela 的修飾核苷可以使寡核苷酸標記變得微不足道。


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